• 2003
    • 3月17日,时任浙江省委书记习近平率浙江省党政代表团赴清华大学,商讨共建浙江省清华长三角研究院事宜
    • 12月31日,浙江省人民政府与清华大学共建浙江清华长三角研究院签约仪式在杭州举行
  • 2004
    • 3月23日,时任浙江省委书记习近平听取浙江清华长三角研究院筹建工作汇报并视察工地
    • 7月,集成光学研究所(先进制造技术研究所)成立
  • 2005
    • 4月10日,时任浙江省委书记习近平出席浙江清华长三角研究院奠基仪式
  • 2006
    • 1月,生物技术与医药研究所、生态环境研究所成立

    • 6月,信息技术研究所成立

  • 2007
    • 11月10日,首创主要污染物排污权交易办法,并推动在嘉兴市设立国内首家排污权储备交易中心
  • 2008
    • 10月29日,时任中共中央政治局常委、国家副主席习近平视察研究院微环境控制技术研究中心
    • 12月22日,总部大楼A座竣工
  • 2009
    • 9月,获批建设浙江省应用酶学重点实验室

    • 10月25日,长三角科学仪器产业技术创新战略联盟成立

    • 12月9日,首届“海外学子浙江行”活动举办

  • 2010
    • 1月8日,发起成立浙江红土创业投资有限公司
    • 4月8日,在美国硅谷挂牌成立硅谷创新基地
    • 8月,获批设立国家级博士后科研工作站
  • 2011

    11月,获批建设浙江省水质科学与技术重点实验室

  • 2012
    • 获批浙江省科学仪器设备产业技术创新服务平台
  • 2013

    1月,首届“海归学子创业座谈会” 举办

  • 2014
    • 5月11日,习近平总书记批示肯定我院十年发展成就
    • 7月9日,首个国家级平台(国家食品安全风险评估中心应用技术合作中心)成立
    • 9月19日,浙江省政府与清华大学在我院举行座谈会,学习贯彻习近平总书记重要批示精神
  • 2015
    • 6月11日,浙华紫旌母基金设立
    • 9月25日,杭州分院(现院地合作办公室(杭州))成立
  • 2016
    • 4月,总部大楼B座竣工
    • 6月7日,全国首家专业科技保险公司“太平科技保险有限公司”获批并落户研究院
    • 9月29日,台州创新中心(现院地合作办公室(台州))成立
  • 2017
    • 8月19日,浙江清华柔性电子技术研究院成立
    • 8月23日,宁波分院(现院地合作办公室(宁波))成立
  • 2018
    • 1月20日,发起成立浙江未来技术研究院
    • 12月26日,建设的“浙江省柔性电子制造业创新中心”被列入省制造业创新中心培育名单
  • 2019
    • 10月22日,“长三角车联网安全浙江省工程研究中心”获批创建省级工程研究中心
    • 12月1日,研究院被写入中共中央、国务院印发的《长江三角洲区域一体化发展规划纲要》
    • 12月11日,浙江清华长三角军民协同创新研究院成立
  • 2020
    • 7月8日,“深根院地合作 建设创新嘉兴”行动计划启动,中国标准化研究院长三角(嘉兴)分院落户
    • 11月18日,研究院入选浙江省省级新型研发机构
    • 12月18日,“柔性电子浙江省工程研究中心”获省级工程研究中心认定
  • 2021
    • 3月19日,(与清华大学材料学院、桐乡市签署合作协议)乌镇实验室成立
    • 9月1日,清华附中嘉兴学校签约建校
    • 12月,获批建设首个国家级重点实验室(柔性电子技术)
  • 2022
    • 2月,总部院区三期工程竣工,园区面积突破30万平方米
    • 5月18日,(与嘉善县政府签署合作协议)祥符实验室(纳米转化医学研究中心)成立
    • 5月26日,与嘉兴市政府、中国中小企业协会三方共建的长三角(嘉兴)专精特新企业服务基地揭牌成立
    • 8月27日,空天材料浙江省工程研究中心(乌镇实验室)获批认定
  • 2023
    • 3月,院企合作“十百千”工程启动
    • 8月22日,(与华润创业签署合作备忘录)香港创新中心成立
  • 2024
    • 7月3日,(乌镇实验室与清华大学签署合作协议)先进陶瓷与精细工艺国家重点实验室分室成立

    • 7月25日,获批牵头建设全省多维组学与分子酶学重点实验室,参与建设全省眼病精准医疗重点实验室

    • 10月29日,与国家动物模型技术创新中心签署合作协议,共建国家动物模型技术创新中心浙江基因编辑特种动物模型分中心

    • 11月6日,院博士后科研工作站经全国博士后管委会办公室批复同意,获得独立招收博士后研究人员资格

  • 2025
    • 3月26日,牵头组建的氢能装备制造业创新中心列入浙江省制造业创新中心培育建设

    • 5月8日,浙江清华柔性电子技术研究院、乌镇实验室中试平台入选首批工信部重点培育中试平台